Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprqP0C5E4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprqP0C5E4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprqP0C5E4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprqP0C5E4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprqP0C5E4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprqP0C5E4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprqP0C5E4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PtprqP0C5E4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PtprqP0C5E4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprqP0C5E4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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PtprqP0C5E4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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PtprqP0C5E4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprqP0C5E4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprqP0C5E4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprqP0C5E4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprqP0C5E4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PtprqP0C5E4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PtprqP0C5E4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PtprqP0C5E4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PtprqP0C5E4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprqP0C5E4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtprqP0C5E4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtprqP0C5E4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprqP0C5E4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtprqP0C5E4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PtprqP0C5E4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprqP0C5E4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PtprqP0C5E4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprqP0C5E4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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