Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hoxc9P09633 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hoxc9P09633 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Hoxc9P09633 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hoxc9P09633 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms