Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa5P09021 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms