Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApoeP08226 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApoeP08226 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApoeP08226 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApoeP08226 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApoeP08226 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApoeP08226 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApoeP08226 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApoeP08226 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApoeP08226 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApoeP08226 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApoeP08226 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApoeP08226 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApoeP08226 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApoeP08226 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApoeP08226 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApoeP08226 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApoeP08226 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApoeP08226 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApoeP08226 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApoeP08226 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApoeP08226 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApoeP08226 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApoeP08226 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApoeP08226 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApoeP08226 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApoeP08226 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms