Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa4P06798 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa4P06798 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa4P06798 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa4P06798 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms