Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06330 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06330 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06330 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06330 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06330 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06330 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06330 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06330 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06330 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06330 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P06330 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06330 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06330 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06330 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P06330 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06330 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06330 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
P06330 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06330 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06330 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06330 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06330 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06330 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06330 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06330 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06330 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06330 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P06330 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06330 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06330 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06330 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06330 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06330 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06330 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06330 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06330 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06330 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06330 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06330 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06330 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06330 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06330 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06330 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06330 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06330 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06330 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06330 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06330 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06330 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06330 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06330 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06330 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06330 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06330 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06330 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06330 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06330 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06330 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06330 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06330 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06330 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06330 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06330 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06330 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06330 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06330 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06330 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06330 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06330 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06330 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06330 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06330 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06330 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06330 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06330 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06330 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06330 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06330 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06330 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06330 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06330 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06330 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06330 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06330 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06330 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06330 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06330 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06330 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06330 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06330 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06330 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06330 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06330 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06330 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06330 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06330 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06330 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06330 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06330 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms