Protein–RNA interactions for Protein: P06329

Ig heavy chain V region AC38 15.3, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06329 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06329 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06329 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06329 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06329 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06329 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06329 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06329 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06329 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06329 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06329 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06329 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06329 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06329 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06329 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06329 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06329 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06329 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06329 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06329 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P06329 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06329 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06329 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06329 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P06329 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06329 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06329 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06329 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06329 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06329 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06329 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P06329 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06329 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06329 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06329 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06329 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06329 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06329 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06329 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06329 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06329 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06329 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P06329 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06329 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06329 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06329 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06329 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06329 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06329 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06329 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06329 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06329 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06329 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06329 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06329 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06329 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06329 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06329 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06329 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06329 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06329 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06329 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06329 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P06329 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P06329 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06329 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06329 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06329 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06329 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06329 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06329 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06329 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06329 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06329 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06329 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06329 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06329 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06329 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06329 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06329 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06329 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06329 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06329 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06329 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06329 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms