Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01878 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
P01878 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01878 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
P01878 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01878 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01878 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01878 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01878 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01878 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
P01878 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01878 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01878 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01878 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01878 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01878 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01878 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01878 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01878 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01878 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01878 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01878 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01878 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01878 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
P01878 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01878 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01878 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01878 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01878 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01878 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01878 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01878 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
P01878 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01878 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01878 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01878 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01878 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01878 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01878 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01878 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01878 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01878 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
P01878 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01878 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01878 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01878 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01878 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01878 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
P01878 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01878 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01878 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01878 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01878 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01878 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01878 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01878 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01878 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01878 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01878 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01878 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
P01878 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
P01878 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01878 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01878 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01878 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01878 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01878 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01878 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
P01878 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01878 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01878 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P01878 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01878 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01878 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01878 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01878 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01878 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01878 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01878 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01878 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01878 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01878 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P01878 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01878 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01878 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01878 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01878 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01878 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01878 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01878 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01878 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01878 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01878 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01878 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01878 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01878 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01878 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01878 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01878 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01878 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms