Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01727 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01727 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01727 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01727 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01727 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01727 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01727 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01727 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01727 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01727 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01727 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01727 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01727 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01727 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01727 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01727 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01727 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01727 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01727 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
P01727 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01727 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01727 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01727 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01727 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01727 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01727 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01727 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P01727 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01727 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01727 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01727 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01727 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01727 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01727 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01727 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01727 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01727 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01727 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01727 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01727 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01727 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01727 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01727 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01727 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01727 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01727 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01727 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01727 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01727 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01727 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01727 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01727 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01727 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01727 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01727 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01727 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01727 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01727 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01727 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01727 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01727 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01727 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01727 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01727 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01727 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01727 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01727 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01727 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01727 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01727 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01727 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01727 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01727 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01727 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01727 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01727 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01727 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01727 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01727 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01727 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01727 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01727 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01727 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01727 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01727 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01727 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01727 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01727 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01727 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01727 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01727 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01727 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01727 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01727 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01727 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01727 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01727 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01727 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01727 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms