Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec11aO88200 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec11aO88200 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.2 ms