Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Srpk1O70551 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Srpk1O70551 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srpk1O70551 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms