Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HcrtO55241 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HcrtO55241 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HcrtO55241 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HcrtO55241 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HcrtO55241 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HcrtO55241 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HcrtO55241 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HcrtO55241 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HcrtO55241 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HcrtO55241 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HcrtO55241 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms