Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trappc3O55013 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms