Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phox2bO35690 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phox2bO35690 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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