Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx1aO35526 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx1aO35526 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stx1aO35526 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms