Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a2O35488 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a2O35488 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms