Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnxbO35452 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnxbO35452 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnxbO35452 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnxbO35452 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TnxbO35452 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnxbO35452 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnxbO35452 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnxbO35452 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TnxbO35452 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TnxbO35452 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TnxbO35452 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnxbO35452 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnxbO35452 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnxbO35452 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnxbO35452 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnxbO35452 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms