Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn9O35239 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptpn9O35239 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 718.1 ms