Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrkcshO08795 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrkcshO08795 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PrkcshO08795 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms