Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube3aO08759 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3aO08759 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms