Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nccrp1G3X9C2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nccrp1G3X9C2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nccrp1G3X9C2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nccrp1G3X9C2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nccrp1G3X9C2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nccrp1G3X9C2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nccrp1G3X9C2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nccrp1G3X9C2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nccrp1G3X9C2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms