Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Srp72F8VQC1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms