Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2564F6Z9S8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2564F6Z9S8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2564F6Z9S8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2564F6Z9S8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Gm2564F6Z9S8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2564F6Z9S8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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