Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21970F6XX07 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm21970F6XX07 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms