Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q5

1700113H08Rik, RIKEN cDNA 1700113H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
1700113H08RikE9Q9Q5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700113H08RikE9Q9Q5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
1700113H08RikE9Q9Q5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700113H08RikE9Q9Q5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700113H08RikE9Q9Q5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700113H08RikE9Q9Q5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms