Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc85cE9Q6B2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms