Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gcnt4E9Q649 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcnt4E9Q649 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcnt4E9Q649 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcnt4E9Q649 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms