Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FancfE9Q5Z5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FancfE9Q5Z5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FancfE9Q5Z5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FancfE9Q5Z5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FancfE9Q5Z5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FancfE9Q5Z5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FancfE9Q5Z5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FancfE9Q5Z5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FancfE9Q5Z5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FancfE9Q5Z5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FancfE9Q5Z5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FancfE9Q5Z5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254.9 ms