Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip11E9Q512 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Trip11E9Q512 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip11E9Q512 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms