Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Speer4f2E9Q366 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4f2E9Q366 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Speer4f2E9Q366 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Speer4f2E9Q366 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Speer4f2E9Q366 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Speer4f2E9Q366 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f2E9Q366 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4f2E9Q366 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms