Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc171E9Q1U1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc171E9Q1U1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc171E9Q1U1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms