Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fndc1E9Q043 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Fndc1E9Q043 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Fndc1E9Q043 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms