Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30bE9PVL6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30bE9PVL6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim30bE9PVL6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms