Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC8

Smok3a, Sperm motility kinase 3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3aC0HKC8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smok3aC0HKC8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smok3aC0HKC8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smok3aC0HKC8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms