Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1B2KF50 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1B2KF50 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1B2KF50 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms