Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3173A6NAS3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3173A6NAS3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm3173A6NAS3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3173A6NAS3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3173A6NAS3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms