Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931406B18RikA2RSL7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931406B18RikA2RSL7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931406B18RikA2RSL7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms