Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTR2

0610012G03Rik, RIKEN cDNA 0610012G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms