Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt27Q9Z320 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms