Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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