Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms