Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tfcp2Q9ERA0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tfcp2Q9ERA0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms