Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF7

Chd1l, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1lQ9CXF7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1lQ9CXF7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms