Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS3Q969F9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms