Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms