Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms