Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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