Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms