Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cntn3Q07409 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms