Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRCA2P51587 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms